流程再造的概念最早来自企业管理。根据定义来说，流程再造是一种企业活动，内容为从根本重新而彻底地去分析与设计企业程序，并管理相关的企业变革，以追求绩效，并使企业达到突破性的成长。企业再造的重点在于选定对企业经营极为重要的几项企业程序加以重新规划，以求其提高营运之效果。目的在为了对于成本、品质、对外服务和时效上达到重大改进。自从流程再造的理念在政府间逐渐推广开来，西方部分发达国家已经率先实施流程再造项目解决行政难题，近年来我国政府也在探索以审批流程再造解决审批难的问题，取得了明显的成效。

        在传统的审计体制下，呈现的是金字塔型的机构体系和职能业务分布，层级太多，伴随着交叉和冗余的机构人员，暗箱操作和滥用职权也防无可防，给政府行政和决策带来很多无法控制和预估的风险。流程再造主要是通过重新识别和评估组织面临的风险点，然后再针对重大的风险点实施风险管理活动，从而更加科学的抵御甚至消除风险，这是通过流程再造进行风险管理的一个基本思路。流程再造和风险管理都是需求和控制导向，两者相互融合和贯通，统一在日常审计业务的全流程体系里。

        通过流程再造是审计机关进行风险管理的主要思路，其核心目标就是改善工作效率降低风险，在这个过程中，观念障碍、体制障碍和操作障碍都不可避免。流程再造一般有两种方法，一是全新设计，二是系统改造。全新设计是在机构和职能发生重大变化的情况下对流程进行系统全面和彻底的改造，系统改造是以现有流程为基础通过对现有流程的清楚简化整合和自动化进行设计。后者是现有大多机构采取的方法。其中ESIA方法是最具有代表性的系统性改造法，E是清除，将不必要的处理环节和相关程序进行清除，S是简化，将复杂的审批流程等转为简化流程的切入口，简化优化内部审批流程，I是整合，经重复、相近的职能部门进行整合，以流程为导向创新组织管理。A是自动化，利用自动化技术加强处理过程，进行全程监控，提高行政效率。